Diagnóstico viral

La metagenómica detecta virus en 6 de 40 pacientes con pruebas negativas
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La metagenómica detecta virus en 6 de 40 pacientes con pruebas negativas

sábado 17 de octubre de 2026, 10:23h

El ISCIII detectó virus en 6 de 40 muestras de líquido cefalorraquídeo con secuenciación metagenómica, herramienta complementaria que aporta pistas, pero no prueba causalidad.

Una investigación liderada por el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) ha evaluado la secuenciación metagenómica viral para buscar virus en muestras de líquido cefalorraquídeo de adultos con sospecha de infección del sistema nervioso central. La técnica permitió detectar virus en algunos casos en los que las pruebas habituales habían dado negativo.

Claves de la noticia

40 muestras analizadas

El equipo estudió muestras de líquido cefalorraquídeo de pacientes con sospecha de infección neurológica y resultados negativos en pruebas previas.

Seis detecciones

Se identificaron secuencias virales en seis casos, y los resultados se confirmaron con técnicas moleculares específicas.

Una herramienta complementaria

La detección de un virus no demuestra por sí sola que sea la causa de los síntomas.

El trabajo, publicado en Journal of General Virology, fue realizado por un equipo del Centro Nacional de Microbiología (CNM) del ISCIII junto con los hospitales universitarios Puerta de Hierro Majadahonda, en Madrid, y Reina Sofía, en Córdoba, y otros grupos de investigación nacionales e internacionales.

La investigación forma parte de la tesis doctoral de Ana Donoso, primera autora del estudio, que desarrolla en el CNM-ISCIII bajo la dirección de María Dolores Fernández-García. Fernández-García lidera el trabajo como responsable del grupo de Gastroenteritis Víricas e investigadora del Área de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP) del Centro de Investigación Biomédica en Red (CIBER-ISCIII).

Una técnica para buscar miles de virus

Las infecciones víricas del sistema nervioso central pueden causar meningitis, encefalitis, mielitis y otras enfermedades neurológicas. En una proporción importante de los casos, las técnicas convencionales no identifican el agente causante. Entre las posibles razones están la variedad de virus capaces de provocar estas infecciones, la escasa cantidad de virus en la muestra o que el panel diagnóstico habitual no incluya todos los virus posibles.

Para abordar esa dificultad, el equipo aplicó secuenciación metagenómica viral con enriquecimiento mediante captura por sondas. Esta metodología permite buscar simultáneamente miles de virus conocidos en muestras clínicas. Se utilizó en 40 muestras de líquido cefalorraquídeo de pacientes con sospecha de infección del sistema nervioso central cuyos resultados en las pruebas diagnósticas previas habían sido negativos.

La técnica detectó secuencias virales en seis muestras: pegivirus humano en tres pacientes, virus Toscana en uno, virus herpes simple tipo 1 en otro y virus varicela-zóster en el sexto. Los resultados se confirmaron mediante técnicas moleculares específicas. En varios casos, además, se recuperaron genomas virales completos o casi completos, lo que permitió estudiar la diversidad genética de los virus.

Hallazgos y límites de interpretación

La identificación de pegivirus humano en tres pacientes con distintos síndromes neurológicos aporta una pista para futuras investigaciones. Según explica el equipo, este virus es relativamente frecuente y puede persistir en el organismo, pero no se ha asociado claramente con una enfermedad concreta. Su presencia en el líquido cefalorraquídeo no demuestra que haya causado los síntomas.

El hallazgo del virus Toscana en una paciente con meningitis apunta a la conveniencia de investigar este virus en casos de meningitis de origen desconocido durante los meses de verano, cuando aumenta la actividad de los flebotomos —insectos similares a mosquitos— que lo transmiten. En otros dos pacientes, la secuenciación identificó herpes simple tipo 1 y varicela-zóster pese a los resultados negativos del panel diagnóstico inicial, lo que respalda el uso de pruebas moleculares complementarias cuando persiste la sospecha clínica.

María Dolores Fernández-García señala que la secuenciación metagenómica puede complementar las pruebas rutinarias en pacientes con sospecha de infección neurológica que siguen sin diagnóstico. También advierte de que encontrar un virus no significa necesariamente que sea la causa de la enfermedad, aunque el hallazgo puede aportar pistas para orientar el diagnóstico y futuras investigaciones.

Referencia del artículo: Donoso A, Pérez AB, Lopez-Dosil M, et al. “Human pegivirus, Toscana virus and herpesviruses identified in cerebrospinal fluid from adults with unexplained neurologic disease, Spain, 2022–2023”. Journal of General Virology. 2026;107:002302. DOI: 10.1099/jgv.0.002302.

La noticia en cifras

TipoDato o preguntaRespuesta
CifraMuestras estudiadas40 muestras de líquido cefalorraquídeo de adultos con sospecha de infección del sistema nervioso central y resultados negativos en pruebas previas.
CifraDeteccionesSe detectaron secuencias virales en 6 de las 40 muestras.
CifraVirus identificadosPegivirus humano en 3 pacientes; virus Toscana en 1; herpes simple tipo 1 en 1 y varicela-zóster en 1.
CifraPublicaciónEl artículo se publicó en 2026 en Journal of General Virology.
Pregunta frecuente¿Qué permite la secuenciación metagenómica viral?Buscar simultáneamente miles de virus conocidos en muestras clínicas mediante secuenciación metagenómica con enriquecimiento por captura de sondas.
Pregunta frecuente¿Un virus detectado demuestra que causó los síntomas?No necesariamente. En particular, la presencia de pegivirus humano en el líquido cefalorraquídeo aporta una pista para futuras investigaciones, pero no demuestra que fuera la causa de los síntomas.
Pregunta frecuente¿Qué utilidad clínica sugieren los resultados?La técnica puede complementar las pruebas rutinarias cuando persiste la sospecha de infección neurológica sin diagnóstico; el estudio identificó virus en algunas muestras con resultados negativos en las pruebas previas.
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